Search results for "rentgenstaru kristalogrāfija"
showing 3 items of 3 documents
Ogļskābes anhidrāzes XII izoformas strukturālie pētījumi
2017
Ogļskābes anhidrāzes katalizē dzīvajos organismos būtisko bikarbonāta un ogļskābās gāzes savstarpējo atgriezenisko reakciju. Cilvēka organismā ir vairākas ogļskābes anhidrāžu izoformas, un dažu izoformu katalītiskā darbība ir nevēlama. Viena no šīm izoformām, ogļskābes anhidrāzes XII izoforma, saistīta ar vairāku ļaundabīgu audzēju attīstību. Maģistra darba iztrādē tika vairākkārtīgi uzlabota ogļskābes anhidrāzes XII izoformas ekspresijas un attīrīšanas sistēma un iegūtas vairākas ar ligandu saistītas ogļskābes anhidrāzes XII izoformas struktūras. Ar proteīnu rentgenstaru kristalogrāfijas palīdzību tika identificētas dažādu inhibitoru konformācijas ogļskābes anhidrāzes XII izoformas aktīvaj…
Bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu ekspresija, attīrīšana un raksturošana
2016
Darbā tika veikta bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu sekvenču analīze un hipotētisko proteīnu ORF3, ORF4, ORF5 un ORF6 eksperimentāla izpēte ar mērķi identificēt to funkcijas. Pētījumu rezultātā praimāzei ORF1 tika atklāts iepriekš neidentificēts helikāzes domēns un ORF8 tika re-anotēts kā resolvāze. Rekombinanti producēts ORF4 bija nešķīstošs, savukārt ORF3 un ORF5 – šķīstoši, un to sekmīga attīrīšana ļauj darbu turpināt ar proteīnu kristalizāciju. ORF6 un delēcijas variantam ORF6Δ21 tika noteiktas kristālstruktūras, kuru analīze kopā ar in vitro eksperimentiem parādīja, ka ORF6 ir ssDNS saistošais proteīns (SSB). Pētījumā pirmoreiz tika atklāta SSB C-terminālā reģiona nozīme …
Gripas vīrusa hemaglutinīna fragmenta strukturāla izpēte un eksponēšana uz vīrusiem līdzīgo daļiņu virsmas
2015
Iekļaujot vakcīnā konservatīvus vīrusa proteīnu domēnus, būtu iespējams nodrošināt plaša spektra aizsardzību pret dažādiem gripas vīrusu apakštipiem. Viens no šādiem konservatīviem rajoniem ir hemaglutinīna (HA) stalka peptīds HA2.3. Bakalaura darba mērķis bija noteikt HA2.3 struktūru, tā eksponēšanas iespējas uz dažādu vīrusiem līdzīgo daļiņu (VLP) virsmas, un pētīt šo daļiņu imunoloģiskās īpašības. Pētījumā tika veikta HA2.3 ekspresija, attīrīšana, kristalizācija. Izmantojot rentgenstaru difrakciju, tika noteikts, ka HA2.3 struktūra vides pH 5,5 atbilst natīvajai HA stalka trimēra post fusion konformācijai. HA2.3 tika ķīmiski konjugēts pie dažādu VLP virsmas, kuras pēc tam izmantoja peļu …